Управление национальным парком «Командорские острова» осуществляет его дирекция – федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный парк «Командорские острова» имени С.В.Маракова» (сокращенное наименование ФГБУ «Национальный парк «Командорские острова»), расположенное на острове Беринга, в селе Никольском.

Основные задачи дирекции национального парка «Командорские острова», как и других национальных парков России, установлены Федеральным законом от 14 марта 1993 года № 33-ФЗ «Об особо охраняемых природных территориях». Так, установлено, что на национальные парки возлагаются следующие основные задачи:
- сохранение в естественном состоянии уникальных и типичных природных комплексов и объектов, объектов растительного и животного мира, естественных экологических систем, биоразнообразия;
- сохранение историко-культурных объектов;
- экологическое просвещение;
- организация и осуществление туризма;
- осуществление научной (научно-исследовательской) деятельности в области охраны окружающей среды в целях разработки мероприятий по сохранению и развитию природного потенциала и рекреационного потенциала Российской Федерации;
- восстановление нарушенных природных и историко-культурных комплексов и объектов;









Так как парк расположен в границах Алеутского муниципального округа в Камчатском крае, в котором компактно проживают коренные малочисленные народы Севера, Сибири и Дальнего Востока – алеуты, то к задачам парка относится также:
- защита среды обитания и традиционного образа жизни коренных малочисленных народов Российской Федерации.



Статус биосферного резервата, полученный Командорскими островами в 2002 году, возлагает на парк задачи организации устойчивого, неистощительного природопользования.
