Полушник морской включен в Красную книгу Камчатки как угрожаемый вид и в Красную книгу России как сокращающийся в численности вид. Этот североамериканский вид в России находится на западной границе ареала и отмечен лишь в двух точках на юго-восточном побережье Камчатки, а также на Командорских островах (нередок в небольших озерах северной части о. Беринга, на о. Медный произрастает в тундровом озере в бухте Ожидания).
Также в небольших озерах острова Беринга (в основном в северной его части) встречается полушник азиатский (Isoёtes asiatica (Makino) Makino), довольно обычный на Дальнем Востоке России вид. В небольших озерах северной части острова Беринга встречается и гибрид между этими двумя видами – полушник паратунский. Кроме острова Беринга, этот гибрид известен лишь из одного озера на юго-восточном побережье Камчатки.